I en spennende og ny eventyrhistorie inspirert av det prisbelønte videospillet fra BioWare, står universet overfor en akutt trussel. Hvert femtiende tusen år invaderer en rase av bevisste maskiner, kjent som Reaperne, vår galakse for å høste alle organiske livsformer. I denne kritiske situasjonen er det to personer som har avdekket den skremmende sannheten: Flåteadmiral David Anderson og hans partner, Kahlee Sanders. De har funnet avskyelige bevis for at Reaper-trusselen er reell. Men i prosessen har de også avdekket hemmelighetene til Cerberus, en hemmelig paramilitær organisasjon ledet av den gåtefulle Illusive Man. David og Kahlee befinner seg i livsfare, ettersom Cerberus ikke vil nøle med å gjøre alt for å beskytte sine hemmeligheter. Langs veien møter de den usannsynlige allieren Gillian Grayson, en ung kvinne med ekstraordinære evner. Tidligere var Gillian gjenstand for skremmende vitenskapelige eksperimenter, men nå er hun fri og begynner å mestre sine dødelige ferdigheter. Imidlertid oppdager hun at Cerberus bærer ansvaret for flere grusomme hendelser, og kampen for å overvinne den onde planen har bare så vidt begynt.
