Den første gangen Jordens helter møtte Beyonder, kjempet de for livet. Denne gangen står kampen om selve eksistensen på spill. Et år etter at han kidnappet de mest mektige vesenene på Jorden og tvang dem til å kjempe mot hverandre i en 'Secret War' på en fjern planet, returnerer den allmektige Beyonder til Jorden for å fortsette sitt studie av menneskeheten. Men en så mektig og samtidig naiv skapning er en farlig kombinasjon. Etter hvert som Beyonders forståelse av menneskeheten vokser, utvikler også hans egne ønsker seg - noe selv løgnens herre, Mephisto, frykter hva kan bety for fremtiden. For hvis Beyonder bestemmer seg for å utrydde alt som er, kan selv de samlede krefter i universets kosmiske makter vise seg utilstrekkelige til å stoppe ham. Denne utgivelsen samler SECRET WARS II #1-9.