I de avsluttende dagene av den første spesialprøven står Klasse D overfor alvorlige utfordringer. Tyven er fortsatt på frifot, og de har hevet innbruddene til å omfatte større gjenstander, noe som kan true poengene til Klasse D. Horikita tar affære og bestemmer seg for å handle, til tross for at hun har feber som bare blir verre. Men hva vil skje med Klasse D hvis lederen faller? Kan det hende at det hele er del av et enda større spel? For de som ser på, kan tilværelsen ved Tokyo Metropolitan Advanced Nurturing High School virke som en oppfyllelse av drømmer. Elevene nyter bemerkelsesverdig frihet, og skolen kan skilte med en nesten 100 prosent plassering i elitejobber og universiteter. Studenter må imidlertid vinne, manejere eller spare nok poeng for å klatre opp i hierarkiet! Ayanokouji Kiyotaka befinner seg i bunnen av dette nådeløse akademiet, i den foraktede Klasse D, hvor han møter Horikita Suzune, en jente som er fast bestemt på å nå toppen.
