Etter at borgerkrigen på Romulus ble avverget, har Kirk endelig muligheten til å avdekke sannheten bak døden til sin eldste og nærmeste venn, Spock. Ble han drept av den mystiske organisasjonen Totality? Starfleet tilbyr ham generøst en romskip som han trenger for å oppnå sitt mål, men med en betingelse: de kan tilkalle ham når som helst de trenger hans hjelp. Kirk har imidlertid mer enn bare Spocks skjebne å bekymre seg for; hans sønn, Joseph, opprører vilt mot begrensningene som er pålagt ham som et resultat av fredsavtalen med romulanerne. Er det en forbindelse mellom Totality og Josephs opprør? Før han kan finne svarene på disse bekymringsfulle spørsmålene, får Kirk en telefon fra admiral Janeway som ber om hans hjelp for å redde Federation. Splittet mellom sitt oppdrag og sin plikt, må Kirk igjen involvere seg i Federationen før han kan rette oppmerksomheten mot sin venn eller sin sønn. Popkulturikonet William Shatner er tilbake med et nytt, spennende Star Trek-eventyr.
