I 'Code Red', er Mitch Rapp tvunget til å oppfylle en skyld han har overfor en mektig kriminell aktør. Oppdraget hans fører ham til Syria, hvor han har som mål å stoppe spredningen av en ny rusmiddel som truer hans territorium. Under oppdraget avdekker Rapp den virkelige trusselen: en høystående russer general og hans team, som har langt større ambisjoner enn bare Syria. Rapp utvikler en plan for å fange generalen og bringe ham til Vesten. Dette er imidlertid en farlig strategi. Hvis Russland skulle oppdage at generalen er blitt tatt av en amerikansk agent, kan det utløse en konfrontasjon mellom de to nasjonene, som har potensial til å utvikle seg til en ustyrlig konflikt.
