I perioden 2000-2001 satte Michael Jackson seg ned med sin nære venn og åndelige veileder, Rabbi Shmuley Boteach, for å dokumentere hva som viser seg å være noen av de mest intime og avslørende samtalene i hans liv. Michael ønsket å åpne opp sjelen sin og lette sitt hjerte til et publikum som han visste var dypt skeptiske til ham. Resultatet ble tretti timer med dyptgående samtaler, som danner grunnlaget for 'Soul of Michael Jackson'. Det har aldri vært, og vil aldri komme til å være, noe lignende. I disse brutalt ærlige samtalene avdekker Michael sin emosjonelle smerte og dype ensomhet, sitt ønske om å bli elsket, samt tomheten han følte knyttet til sin berømmelse. Her får leserne innsikt i hvorfor han var mistenksom overfor kvinner og hvordan kun barn kunne gi ham den uskylden han så sterkt lengtet etter. I egne ord tar han oss med tilbake til de sjokkerende øyeblikkene fra barndommen og beskriver tiltakene han tok for å prøve å lege sine indre sår. Han deler også hvordan han ble fremmedgjort fra sitt sterke religiøse fundament og gir oss et innblikk i sine tanker om tro. Michael fører oss inn i hans indre verden.