I "The Unbreakable Code" står Emily og James overfor en mystisk utfordring som setter deres detektivferdigheter på prøve. Det hele starter med at Mr. Quisling avslører en kryptisk melding under en bokbegivenhet, noe som setter alarmklokkene til de unge vennene i sving. I tillegg avdekker de en rekke hemmeligheter skjult i Mark Twains bøker, som er plassert strategisk gjennom Book Scavenger. Men det som virkelig vekker deres mistanke, er at hver av de skjulte bøkene ser ut til å være knyttet til en pågående serie branner. Når de graver dypere, avslører de at Quisling er på jakt etter et legendarisk historisk mysterium kjent som den Unbreakable Code. Dette nye mysteriet virker umulig å motstå, men både Emily og James er stadig mer overbevist om at Quisling kanskje har en annen agenda - han kan være den ansvarlige for brannene. Tiden er i ferd med å renne ut ettersom antallet branner øker, og vennene må løpe mot klokken for å løse livets kode.