Reconstruction: Heal or Kill utspiller seg i en liten by i Illinois i 1871 og gir en gripende skildring av livet på landsbygda i Amerika. Romanen avdekker fordommene mot frigjorte slaver i perioden etter borgerkrigen, en tid preget av terror fra Ku Klux Klan. Hovedkarakteren, Tom, en tenåring, hadde i utgangspunktet planlagt å vie livet sitt til å kjempe mot indianere. Alt endrer seg når en ny lege, utdannet i Edinburgh, ankommer byen med dampskip og overbeviser ham om at det er bedre å lege enn å drepe. Den nye legen, en tidligere unionssoldat, er en dyktig skytter, røyker whisky og spiller kort. Innbyggerne i byen er skeptiske til ham, men når han redder en venn av president Grant, begynner folks holdning å endre seg. Tom får nå et kall om å bli lege, men livet hans tar en dramatisk vending når faren dør, og han blir sendt til et barnehjem. Han klarer å rømme, men står overfor livsfarlige forhold i kulden. En familie av frigjorte slaver pleier ham tilbake til helse, samtidig som Klanen og den lokale sheriffen terroriserer dem for å forsyne seg av deres eiendom. Tom tar på seg rollen som legens assistent og lærer medisin ved å grave opp et skjelett for å studere anatomi. I denne reisen står han også til disposisjon for å beskytte familiens rettigheter.