I en tid preget av den kalde krigen, når hysteri og mistillit preger Amerikas gater, får FBI et varslet besøk til et par som er anklaget for kommunistisk virksomhet i sin New York-leilighet. Etter en rettssak som splitter nasjonen, står de overfor den ultimate straff for forræderi – dødsstraff ved elektrisk stol. Mange år senere, i 1967, zijn deres sønn Daniel på en reise for å forstå de tragiske omstendighetene som har rammet hans familie og livene deres. 'The Book of Daniel' tar leseren med på en emosjonell og samfunnsmessig utforskning av identitet, rettferdighet og de langvarige konsekvensene av politiske konflikter.