Basert på den sanne historien om den modige tyske sykepleieren Helene Hannemann, som fikk i oppdrag å ta vare på de yngste fangene i Auschwitz, gir 'Auschwitz Lullaby' en gripende skildring av en kvinne som ofret alt for familien sin og kjempet utrettelig for å redde barna hun elsket. I 1943, på en tilsynelatende vanlig morgen, forbereder Helene å sende de fem barna sine av gårde for dagen når tyske politifolk dukker opp hjemme hos henne. Hennes verste mareritt blir til virkelighet når politiet, under strenge ordre fra SS, krever at både hennes barn og ektemann, alle av romani-herkomst, skal tas i arrest. Selv om Helene er tysk og dermed fri fra forfølgelsen, nekter hun å forlate sin familie, noe som forsegler skjebnen hennes på en måte hun aldri kunne ha forestilt seg. Etter en skremmende reise over kontinentet ankommer Helene og familien Auschwitz, hvor de blir kastet inn i leiren kaos. Hennes ektemann, Johann, blir skilt fra dem, men Helene forblir en sta og beskyttende mor som står opp for sine barn og de rundt henne.