I denne actionfylte offisielle tilpasningen av Alien: Isolation får vi et dyptgående innblikk i livene til Ellen Ripley og hennes datter, Amanda Ripley. Amandas liv har vært preget av motgang fra fødselen av. Foreldrene hennes lever på fattigdomsgrensen, noe som fører til at moren, Ellen Ripley, tar jobber utenfor jorden for å sikre inntekt. Hun får en stilling om bord på det kommersielle romskipet Nostromo. Når dette fartøyet forsvinner i dyprommet, blir Amanda drevet av ett mål: Å finne ut hva som skjedde med Ellen Ripley. Amandas jakt på sannheten tar henne inn i samfunnets skyggesider, hvor få kan stoles på. På Luna møter hun noen som virker som et unntak - Private Zula Hendricks fra Colonial Marines - men deres forhold blir kortvarig. Akkurat når det ser ut til at Amanda har nådd bunnen, dukker det opp en ledetråd. For å følge denne ledetråden må hun begi seg til den avsidesliggende Sevastopol-stasjonen, hvor hun håper å finne svarene hun søker. Men stasjonen er i ruiner, og døden lurer i korridorene.
