Etter å ha unnsluppet en Xenomorph-innsats og krasjlandinger på feil planet, ønsker den tidligere militærmannen Chris Temple bare et fredelig liv sammen med sine døtre. Men han må håndtere en tilspisset borgerkrig og en løpske Xenomorph. Krig vil alltid finne en mann som ham. Historien i ALIEN-universet begynner der de fleste ender: med en Xenomorph løs på et skadet romskip som føres gjennom verdensrommet. Chris Temple, en høyt dekortert marine, er nå en enkemann som tar seg av sine to unge jenter, Jane på 11 og Emma på 8. Til tross for hans imponerende ferdigheter i kamp, velger Chris å ikke blande seg inn i kampen mot aliens, og fokuserer i stedet på å holde barna sine trygge mens romskipet går inn for en nødlanding. Familien lander tryggt på en idyllisk utpostplanet, hvor Chris blir informert om at skipet er ødelagt utover gjenkjenning og at ingenting kunne ha overlevd krasjet. Dette er imidlertid bare den første løgnen. Chris og døtrene elsker sitt nye liv, men noe føles ikke riktig.
