Den spesielle FBI-agenten Elizabeth Keen er på rømmen etter å ha blitt feilaktig anklaget for mord og for å være en KGB-agent av den hemmelige organisasjonen CABAL. I et desperat forsøk på å finne bevis som kan frikjenne henne, kaster hun seg inn i en farlig jakt. Samtidig fører en notorisk Blacklister, kjent som Ethan Donovan, også kalt The Arsonist, en ensom krig mot CABAL. Med sin spesialitet i å 'forsvinne' industriell størrelse problemer, tar han til de mest drastiske metoder for å ødelegge denne mektige organisasjonen, bokstavelig talt ved å sette fyr på den. I denne nervepirrende fortellingen følger vi Elizabeth Keen på hennes risikofulle ferd for å oppnå sannhet og rettferdighet, mens Ethan fortsetter sitt ødeleggende arbeid mot en fiende av stor skjebne.
