I Kamome Akademiet svirrer det mange rykter om skolens sju mysterier, hvorav ett er den legendariske Hanako-san. Det sies at hun befinner seg i den tredje toalettbåsen på jenterommet i den gamle skolebygningen, og at hun kan oppfylle alle ønsker når noen kaller på henne. Nene Yashiro, en tenåringsjente med en forkjærlighet for det overnaturlige og drømmer om romantikk, tar mot til seg og trår inn i dette forheksede toalettet. Men han som svarer på hennes kall, er langt fra det hun hadde forestilt seg! Kamome Akademiets Hanako-san er nemlig en gutt!