I den dystopiske verdenen av Tokyo Ghoul er kampen mot monstre en uunngåelig realitet. Kommisjonen for Bekjempelse av Ghouler (CCG) er den eneste organisasjonen som står opp mot denne trusselen, og de er villige til å bruke alle tilgjengelige midler for å beskytte menneskeheten fra den ultimate rovdyr. I denne skjulte krigen får de tilgang til en ny og eksperimentell teknologi som implanterer menneskelige etterforskere med ghoulenes kagune, som gir dem overnaturlige krefter og evner. Imidlertid er både prosedyren og det nyopprettede Qs Squad fortsatt utestet. Vil de bli helter, eller forvandles de til monstre? Haise Sasaki er historie. I hans sted har Ken Kaneki trædt frem som den éne-øyde kongen, med en visjon for fremtiden hvor ghouler og mennesker kan leve i harmoni. Men en fraksjon innen CCG vil for enhver pris hindre denne freden, uansett hvor mange liv det måtte koste.
