I verden av Tokyo Ghoul er det noen ganger slik at den eneste måten å bekjempe monstre på, er å bli en av dem. Kommisjonen for å Bekjempe Ghoul er den eneste organisasjonen som står imot ghoulenes trussel, og de er villige til å bruke alle tilgjengelige verktøy for å beskytte menneskeheten fra sine ultimate rovdyr. Deres nyeste våpen i denne skjulte krigen er en eksperimentell prosedyre som implanterer menneskelige etterforskere med en ghoul's Kagune, noe som gir dem krefter og evner som likner ghoulenes. Men både prosedyren og det nyopprettede Qs Squad er utestet. Vil de bli helter... eller monstre? Mens Haise er fast bestemt på å hjelpe sine gamle venner med å rømme fra Cochlea-fengselet, ønsker han ikke å skade noen av sine kolleger i CCG. Men hans mentor, Kisho Arima, tar avgjørelsen ut av Haise sine hender, og bekrefter noen av Haise sine største frykter om organisasjonen som har blitt hele hans liv. Han har allerede mistet alt en gang før. Hvordan vil han takle å oppleve dette på nytt?
