I Tokyo Ghoul, Vol. 12, fortsetter historien om Ken Kaneki, en vanlig universitetsstudent som har blitt en hybrid mellom menneske og ghoul etter en voldsom hendelse. I en verden hvor ghouler lever blant vanlige mennesker, men med en kritisk hungersnød etter menneskekjøtt, må Kaneki navigere i et komplisert landskap preget av gjengkriger og intriger. I denne utgaven opplever vi en intens konflikt i 4. distrikt, hvor assistentspesialetterforsker Arima fra Kommisjonen for motghoul setter søkelyset på ghoulenes aktivitet. Amon, en av hovedfigurene, avdekker en forbindelse mellom CCG og et hemmelig laboratorium som angivelig forsker på å forvandle mennesker til ghouler. Samtidig gjenoppstår et gammelt partnerskap, noe som kan skape nye problemer for det 20. distriktet. Kaneki må bruke sine nye krefter og lære mer om ghoul-samfunnet for å overleve i denne kaotiske tilværelsen.