BioShock: Rapture tar oss med tilbake til opprinnelsen av den famøse undervannscivilisasjonen Rapture, som ble skapt av den visjonære immigranten Andrew Ryan. Handlingen finner sted på slutten av andre verdenskrig, en tid preget av politiske omveltninger og en frykt for total ødeleggelse etter bombingen av Hiroshima og Nagasaki. Mens skattenivåene stiger og myndighetenes kontroll overforretninger intensiveres, føler mange amerikanere at deres frihet er truet. I dette mørke landskapet stiger Ryan frem som en drømmer som har hevet seg opp fra dypet av fattigdom for å bli en av verdens rikeste og mest beundrede menn. Han er fast bestemt på å skape en utopi, helt fri fra regjeringens inngripen, sensur og moralske begrensninger på vitenskapen. I kampen for å gjenvinne friheten etablerer han Rapture, den strålende byen under havet, hvor ideen om at 'det du gir, er det du får', er den grunnleggende prinsippet. Boken er en knakende prequel til det prisbelønte og bestselgende BioShock-videospillet, og gir leserne et dypere innblikk i hvordan Rapture, som starten som et lysglimt av håp, gradvis forvandlet seg til en dystopisk tilstand.
