I sommeren 1947, da opprettelsen av staten Pakistan ble formelt annonsert, var ti millioner mennesker – muslimer, hinduer og sikher – på flukt. Innen monsunen startet, var nesten en million av dem døde, og hele Nord-India var i opprør, i frykt eller i skjul. De eneste gjenværende fristeder for fred var en rekke små landsbyer som var tapt i de avsides delene av grensen. En av disse landsbyene var Mano Majra, et sted der sikher og muslimer hadde levd sammen i harmoni i hundrevis av år. Men en dag, på slutten av sommeren, ankommer "spøkelsestoget"; et stille, forferdelig begravelsestog lastet med likene av tusenvis av flyktninger, som bringer landsbyen sin første smakebit av de grusomheter som følger med borgerkrigen. "Train to Pakistan" handler om denne isolerte landsbyen som blir kastet inn i avgrunnen av religiøs hat. Boken forteller også historien om en sikh-gutt og en muslim-jente og deres kjærlighet, som blir testet av de katastrofale hendelsene som omgir dem.