Mars 1997. Bak en bar i Carter Crossing, Mississippi, blir en kvinne brutalt myrdet med kuttet strupe. Like nedover veien ligger en stor militærbase. Er morderen en lokal innbygger, eller kan det være en soldat? Jack Reacher, som fortsatt er major i militærpolitiet, blir sendt inn for å etterforske undercover. Den lokale sheriffen er en tidligere U.S. Marine, i tillegg til å være en bemerkelsesverdig vakker kvinne. Hennes etterforskning ser ut til å stå stille, og hun begynner å stille spørsmål ved om Pentagon motarbeider henne, eller om hun egentlig ikke ønsker å finne morderen. "The Affair" byr på intens, høyenergisk action og finner sted bare seks måneder før hendelsene i "Killing Floor", og markerer et vendepunkt i Reachers karriere. Hvis han følger militærens ordre, vil han kunne leve med seg selv? Og hvis han velger å motsette seg dem, vil han kunne fortsette i sin stilling? Er dette hans siste oppdrag i uniform?
