I denne spennende utgaven av «Persona 3» følger vi Aigis, en android konstruert som en anti-Skygge våpen, mens hun konfronterer dyptgående spørsmål om sin egen identitet og formål. Hvem er jeg? Hvorfor må jeg kjempe? Og hvilken plass har Minato i mitt liv? Disse tankene sirkler i Aigis' sinn når hun reflekterer over det hun holder mest kjært. Denne delen av serien dykker dypt inn i Aigis' indre kamp og hennes søken etter mening i en verden fylt med utfordringer.