Boken 'Nested Ecologies' utforsker hvordan funksjonell medisin benytter systembiologi og epigenetisk vitenskap for å behandle mikrobiomet og reversere kroniske sykdommer. Hver kropp representerer et system i et større system—et økosystem innenfor den bredere konteksten av sosiale, politiske, økonomiske, kulturelle og miljømessige faktorer. Dette er en av lærdommene fra epigenetikk, hvor strukturelle ulikheter bokstavelig talt er kodet inn i våre gener. Men vår økologiske tilknytning går dypere enn bare DNA, da hver kropp også er hjem til billioner av bakterier, gjær og sopp, som alle er avtrykk fra vårt individuelle miljø. 'Nested Ecologies' stiller spørsmål ved hva det innebærer å ta vårt mikrobielle vesen på alvor, gitt at våre indre økologier formes av ulikheter som er innebygd i våre fysiske og sosiale omgivelser. Rosalynn Vega argumenterer for at helsepraksiser som fokuserer på pasientens unike biologi utilsiktet gjentar systematiske urettferdigheter. Spesielt funksjonell medisin, som forsøker å helbrede kroniske sykdommer ved å utnytte epigenetisk vitenskap og behandling.
