Jiro Azuma, en ninja med en stor kjærlighet for dyr, opplever en dramatisk forandring når han blir kastet inn i en intens konflikt mellom ninjaer og demoner. Som etterkommer av en lang rekke shinobi har Jiro også en spesiell evne til å kommunisere med dyr. Hans liv tar en uventet vending da han redder en bemerkelsesverdig svart katt ved navn Rago, som viser seg å være en overnaturlig skapning. Denne hendelsen introduserer ham for en hemmelig krig av mytologiske proporsjoner. I en illusjon skapt av Fuyo, må Jiro og Rago konfrontere den formidable mononoke, Amagi. Under Edo-perioden forsøkte Amagi å samle allierte for å kjempe mot det nyetablerte Oniwabanshu, men Rago nekter å bli med på hans side. Hvilke hemmeligheter skjuler seg i dypet av Rago sine tapte minner?
