I "Boy's Abyss, Vol. 2" blir leseren tatt dypere inn i den dystre tilværelsen til hovedpersonen Reiji, en tenåring som sliter med å finne sin plass i en håpløs småby. Omstendighetene rundt ham er preget av egeninteresse fra voksne og knuste drømmer, noe som presser Reiji nærmere avgrunnen. Livet hans er preget av tristhet, og den mest bemerkelsesverdige hendelsen i byen - en dobbel selvmordsepisode ved elva - legger en tung skygge over hverdagen. Er Reiji i stand til å påvirke sin egen skjebne, eller vil han også bli en del av avgrunnen? I kampen for å redde ham står han overfor sine lærere, som Ms. Shiba, og bestevennen Gen, hvis intensjoner er tvilsomme og metoder uklare. Samtidig forfølger Chako besettende forfatteren hun beundrer, mens popidolet Nagi konspirerer for å holde grepet om Reiji. Denne gripping historien utforsker kampene med depresjon og søken etter mening midt i kaos.
