Kan det virkelig være mulig for detektiv Conan å løse saker mens han er fanget i kroppen til en liten gutt? Jimmy Kudo, sønnen til en verdenskjent krimforfatter, er en talentfull videregående detektiv som har løst mange av de mest perplexe gåtene. En dag, mens han er på date med barndomsvennen Rachel Moore, kommer Jimmy over mistenkelige menn i svart som driver med kriminell aktivitet. De fanger ham og gir ham et giftig stoff for å eliminere deres vitne. Men i stedet for å drepe ham forvandler stoffet ham til en liten gutt! Under pseudonymet Conan Edogawa fortsetter han å løse vanskelige saker som kommer hans vei, mens han samtidig leter etter mennene i svart og den mystiske organisasjonen de tilhører, i håp om å finne en kur for sin lille ulykke. I denne vol. 2 må Conan håndtere drapet på en mann som brenner levende, der hovedmistenkte har en tilsynelatende vannett alibi; han hjelper en tilsynelatende uskyldig jente med å lete etter faren sin; og han får også tid til å utforske et hjemsøkt hus sammen med sine nye venner.
