Kan detektiv Conan løse saken... mens han er fanget i en barns kropp? Jimmy Kudo, sønnen til en verdenskjent krimforfatter, er en videregående detektiv som har løst de mest intrikate mysteriene. En dag, mens han er på date med barndomsvennen Rachel Moore, observerer Jimmy to menn i svart som er involvert i noe suspekt. Mennene fanger Jimmy og gir ham et giftig stoff for å eliminere deres vitne. Men i stedet for å ta livet av ham, forvandler det ham til et lite barn! Jimmy tar på seg pseudonymet Conan Edogawa og fortsetter å løse alle de vanskelige sakene som dukker opp. I tillegg er han på jakt etter mennene i svart og den mystiske organisasjonen de tilhører, alt i håp om å finne en kur for sin yngre kropp. Når Jimmy, Rachel og Richard drar på cruise, aner de ikke at overhodet til den velstående Hatamoto-familien snart vil bli myrdet. Med morderen fortsatt om bord, kan du finne ut hvem som er skyldig før Conan gjør det?
