Kan det være at Detektiv Conan klarer å løse gårsdagens mysterier, selv i en barnets kropp? Den talentfulle videregående skoledetektiven Jimmy Kudo blir utsatt for et mystisk stoff av to skurker i svarte dresser – og vips! Han blir fysisk transformert til en førsteklassing. Før Jimmy finner en kur for sin miniatyrtilstand, tar han på seg pseudonymet Conan Edogawa og fortsetter å løse de mest intrikate sakene som kommer hans vei. I denne utgaven følger vi med på flere spændende utviklinger: Conan og Rachel oppdager at noen utgir seg for å være Detektiv Moore og utfører gode gjerninger, men hva er motivasjonen bak dette? En rekke trusselnotater etterlatt på biler gir Detektiv Chiba muligheten til å løse en sak sammen med sitt barndomsforelskelse, den nyankomne politibetjenten Naeko Miike. Samtidig fører en sjokkerende død på et bryllupsarrangement til en oppsiktsvekkende hemmelighet. Når Conans etterforskning av bryllupet leder ham til en undercover-detektiv som jobber med den samme saken, finner han seg selv på sporet av et enda større mysterium...
