I denne postapokalyptiske fantasiverdenen blir alt fortidens minner oppslukt av en endeløs sandhav. Mud Whale, en flytende øyby av leire og magi, driver i denne ørkenen. Her lever et lite samfunn i strid for overlevelse, isolert fra sin egen historie, som er kastet i skyggen av fortiden. Kampen om Mud Whale blir en dødbringende tilstand, ettersom de 'Merkede' kjemper for å beskytte både hjemmet sitt og sine medkammerater fra de invaderende apátheia-soldatene. Samtidig har Chakuro og resten av mannskapet greid å nå det keiserlige krigsskipet Skyros, men deres oppdrag tar en blodig vending når de når den thymia-sikre kammeret i skips hjertet. Hvordan kan de ødelegge fienden Nous og redde Mud Whale uten tilgang til sine krefter?
