I denne spennende fortsettelsen i D.Gray-man, Vol. 9, møter vi den forbannede tenåringen Allen Walker, som kjemper for å redde menneskeheten, ett sjel av gangen. Handlingen er satt til en fiktiv versjon av 1800-tallets England, der Allen, en 15 år gammel gutt, reiser rundt i verden på leting etter Innocence – en mystisk substans brukt til å lage kraftige våpen som kan utslette demonene kjent som akuma. Etter å ha blitt ført til uutforskede deler av verden etter Den store oversvømmelsen, er Allen nå på jakt etter dette verdifulle materialet. Samtidig ankommer horder av akuma Edo for å slutte seg til greven, som har oppdaget en pervertert måte å bruke et av de mest berømte bibelske artefaktene på. I mellomtiden har en akuma infiltrert den asiatiske avdelingen av Den mørke orden, med det mål å tilintetgjøre Allen en gang for alle. Allen ser ut til å være dømte til å feile, men den ukjente naturen av akumaens angrep setter i gang hendelser ingen kunne ha forutsett, som kan ende opp med å forandre verdens skjebne!
