I en post-apokalyptisk verden preget av ødeleggelse og elendighet, står vi overfor en surrealistisk historie med kampen for overlevelse i et fengsel bygget på ruinene av Tokyo. Ganta Igarashi, en middelbarnselev, er urettmessig tiltalt for de brutale mordene på klassekameratene sine av den mystiske Røde Mannen. Som straff blir han dømt til døden og sendt til et bisart og dødelig temapark/fengsel, kjent som 'Deadman Wonderland', som har reist seg fra ruinene av det store Tokyo-jordskjelvet. I dette helvetet på jord, returnerer Ganta til kamp og redder Senji fra en sikker død i kampen mot Toto Sakigami. Selvom Toto besitter overveldende krefter, bruker Ganta en smart strategi for å påføre Toto et avgjørende slag. Senji, inspirert av Gantas mot, følger raskt opp med å skjære Toto sammen med bygningen. Mens Toto antas å være knust til døde av den sammenraste strukturen, gjenstår spørsmålet: Er han virkelig ute av spill?