Forestill deg å våkne opp i en verden hvor alle mennesker har blitt forvandlet til stein. På en skjebnesvanger dag ble hele menneskeheten petrifisert. Mange tusen år senere klarer Taiju å bryte fri fra denne tilstanden og finner seg selv omgitt av steinskulpturer. Situasjonen ser dyster ut – helt til han møter sin vitenskapsinteresserte venn Senku! Sammen legger de en plan for å gjenopprette sivilisasjonen ved hjelp av vitenskapens makt. Etter Hyogas forræderi sverger Senku og Tsukasa å kjempe sammen som et uslåelig team. I tillegg fortsetter de med teknologiske fremskritt for å avdekke mysteriet rundt petrifiseringen, men det kommende eventyret på de åpne havene krever både et skip og en kaptein! Det er på tide å gjenoppleve oppdagelsenes tidsalder!
