Forestill deg å våkne opp i en verden der hvert eneste menneske har blitt mystisk forvandlet til stein... En skjebnesvanger dag ble hele menneskeheten til stein. Mange tusen år senere klarer Taiju å befri seg fra petrifiseringen og finner seg selv omgitt av statuer. Situasjonen ser dyster ut—helt til han møter sin vitenskapsglade venn Senku! Sammen planlegger de å gjenopprette sivilisasjonen ved hjelp av vitenskapens kraft! Nå begynner løpet over Sør-Amerika mens teamet dykker inn i Amazonas regnskog, i håp om å finne kilden til petrifiseringen. Når de ankommer, oppdager Senku og vennene et syn som er så fullt av ondskap at det er kvalmende! Dypere inn i Amazonas—i det såkalte Steinsanktuariet—nærmer den endelige kampen mot Stanley seg!
