Tenk deg å våkne opp til en verden der alle mennesker har blitt mystisk forvandlet til stein. En skjebnesvanger dag ble hele menneskeheten til stein. Mange tusen år senere klarer Taiju å frigjøre seg fra denne forsteining, og han finner seg selv omringet av statue-liknende figurer. Situasjonen virker håpløs, helt til han møter sin venn Senku, som elsker vitenskap! Sammen legger de en plan for å gjenopprette sivilisasjonen på nytt ved hjelp av vitenskapens kraft. For å vinne den kommende kampen uten å sverte sine hender med blod, bestemmer Senku og vennene hans seg for å infiltrere Tsukasa-imperiet og sette opp en hemmelig hotline. Men hvem vil svare på den første, avgjørende telefonanropet? I mellomtiden jobber Kongeriket for vitenskap hardt med å utvikle en dampmaskin til deres motorvogn! Det er på tide å bringe den industrielle revolusjonen til steinverdenen!