Å bryte naturens lover er en alvorlig forbrytelse! I et alkemisk rituale som gikk fryktelig galt, mistet Edward Elric både arm og bein, mens broren Alphonse forvandlet seg til intet annet enn en sjel i en rustning. Når Edward utstyrer seg med mekaniske "auto-mail" lemmer, blir han en statlig alkemiker, og han er fast bestemt på å finne det ene som kan gjenskape kroppene deres - den legendariske Filosofersteinen. I denne spennende fortsettelsen har den psykopatiske morderen Barry the Chopper, hvis sjel nå befinner seg i en rustning, blitt fanget av oberst Mustang sine tropper. For å hindre at han avslører konspirasjonen rundt Filosofersteinen, bestemmer Gluttony og Lust seg for å eliminere ham, og bruker Barrys opprinnelige sjelløse kropp for å spore ham opp! Til tross for at oberst Mustang forutser deres trekk og forbereder et bakholdsangrep, viser Gluttony og Lust seg å være for sterke og kjemper seg lett gjennom forsvaret, der Al og løytnant Hawkeye beskytter Barry. Midt i en grusom kamp ofrer oberst Mustang alt i et desperat forsøk på å stoppe Lust!
