I 'Kamisama Kiss, Vol. 3' fortsetter historien om Nanami Momozono, en ung kvinne som, etter å ha blitt kastet ut fra leiligheten sin på grunn av farens gamblingproblemer, uventet arver en helligdom. Dette medfører ikke bare en ny tilværelse, men også magiske krefter og en sjarmerende, men utfordrende, ruggende revånd. Nanami må venne seg til livet som en lokal guddom, noe som fører til at hun ofte mangler skolegang på grunn av sine nye plikter. Hver gang hun prøver å tilpasse seg livet i klasserommet, skjer det noe som forstyrrer, og hennes trang til å redde dyr har begynt å få uventede konsekvenser. Nå må hun navigere mellom forpliktelsene som gudinne og de utfordringene som følger med å være en tenåring. Vil Nanami klare å balansere sitt nye liv, eller er hun i ferd med å bli merket for livet – eller verre?