Bli med på fantastiske eventyr inspirert av de bestselgende Pokémon Ruby og Sapphire videospillene! Alle dine favorittkarakterer fra Pokémon-spillene tar liv i dette actionfylte mangauniverset. Ruby og Sapphire setter kursen mot hver sin drøm i løpet av åtti dager, men skjebnen fører dem stadig tilbake til hverandre. Mens Ruby er på jakt etter en vakker ny Pokémon i Dewford Town for å trene til Pokémon Contests, møter han Sapphire, som er opptatt med å utfordre den lokale gymlederen for å forbedre sine ferdigheter i Pokémon-kamper. Sammen legger de ut på en reise for å levere et viktig brev. Hva står det i brevet, og hvem er den mystiske mottakeren? I tillegg står de overfor utfordringer fra det onde Team Magma, som har planer om å stjele en merkelig ny teknologi. Kan Ruby og Sapphire stoppe dem før det er for sent?
