Følg med på en engasjerende reise når dine favorittkarakterer fra Pokémon-spillene tar liv i denne spennende mangaen! Legendariske Pokémon som Kyogre og Groudon blir sluppet løs, noe som fører til at verden havner i kaos. I et forsøk på å stoppe dem, drar Ruby og Sapphire ned til Seafloor Cavern. Situasjonen forverres når Archie og Maxie, lederne av det onde Team Aqua og det like onde Team Magma, manipulerer Kyogre og Groudon med den blå og røde orben. Men er det virkelig Pokémonene som kontrollerer dem? Samtidig prøver Wally å bygge opp styrken sin for å trene med Rubys far, Gym-leder Norman. Bli med på dette episke eventyret hvor all spenningen fra Pokémon-universet tas med inn i mangaens sider!