Bli med på fantastiske eventyr inspirert av de bestselgende Pokémon Omega Ruby og Alpha Sapphire videospillene, hvor historien tar videre fra Pokémon Adventures Ruby og Sapphire-sagaen! Ruby, Sapphire og Emerald står overfor en ny krise av episke proporsjoner – en gigantisk meteor nærmer seg jorden! Årene har gått, og nå trener Sapphire og Emerald i de nye teknikkene for Mega Evolution for å forberede seg på den kommende trusselen. De trenger Rubys hjelp! På sin reise for å finne en måte å endre meteorets kurs, drar Ruby til Sky Pillar for å vinne tilliten til Zinnia, bokenkeeperen til den mystiske Draconid-stammen. Har hun nøkkelen til å redde verden? Og hvilken rolle spiller Legendary Pokémon Rayquaza i denne dramatiske historien?