Opplev spennende eventyr inspirert av de bestselgende videospillene Pokémon Omega Ruby og Alpha Sapphire, der historien fortsetter der Pokémon Adventures Ruby og Sapphire sagaen slapp! Ruby, Sapphire og Emerald står overfor en ny krise av episke proporsjoner – en gigantisk meteor er på vei mot planeten! Når Emerald, Sapphire og Steven ankommer Sea Mauville for å trene, blir Emerald angrepet av en mystisk Pokémon. Samtidig sliter Ruby med å finne ut hvem som virkelig har makten og ønsket om å redde verden. Kan det egentlig være Ruby selv?! Hva er grunnen til at Team Aqua og Team Magma har søkt sammen med onde krefter? Bli med på dette actionfylte eventyret der vennskap, mot og mystikk står i sentrum!