Bli med på en fantastisk reise inspirert av de bestselgende Pokémon Omega Ruby og Alpha Sapphire videospillene, som tar deg med videre etter begivenhetene i Pokémon Adventures Ruby og Sapphire-sagaen. I denne spenningsfylte historien står Ruby, Sapphire og Emerald overfor en ny krise av episk størrelse – en gigantisk meteor, som truer med å ramme planeten vår! I den hjertebankende finalen må Ruby og Sapphire samarbeide med gymledere, Frontier Brains, Elite Four og til og med tidligere fiender, inkludert sin archenemy Giovanni, for å redde verden. Men det viser seg at meteoren de har vært på sporet av, ikke er den eneste faren på vei mot jorden! Zinnia besitter nøkkelen til å redde alle, men hun er ute av spill. Hvem vil gå sammen med Ruby og Rayquaza for å redde dagen?