I "Rainbow Days, Vol. 12" følger vi fire mannlige venner som støtter hverandre gjennom tenåringskjærlighetens fargerike oppturer og nedturer. Disse vennene kunne knapt vært mer forskjellige: Natsuki Hashiba er en drømmer som lengter etter kjærlighet, Tomoya Matsunaga er en selvopptatt playboy, Keiichi Katakura har en sjarmerende personlighet med en skjult rampete side, og Tsuyoshi Naoe er en sosialt klønete nerd med en lidenskap for anime, manga og spill. Sammen opplever de en tid på videregående skole fylt med livlige, regnbuefargede øyeblikk. Et nytt komplisert kapittel oppstår når Mari forteller Anna at hun er forelsket i henne. Hvordan vil dette påvirke vennskapet deres, og hvilken konsekvens får det for Natsuki og Matsun i deres uoppløste kjærlighetsfølelser?