I en post-apokalyptisk verden hvor vampyrer kjemper mot mennesker, søker Yuichiro hevn mot sine vampyroverherrer! Etter at apokalypseblåserne proklamerer menneskehetens fall, trer vampyrer frem fra skyggene for å herske over jorden. Yuichiro har kun ett mål - å ta hevn ved å drepe hver eneste vampyr. Tre måneder har gått siden invasjonen i Nagoya, og Yuichiro, Mika og Shinoa Squad er nå på flukt fra både vampyrene og menneskene! Akkurat når de bestemmer seg for å be Krul Tepes om hjelp, blir de overrasket av Ferid Bathory og Crowley Eusford, som kommer med et mistenkelig forslag om å bli gruppens nye bestevenner. De tar med seg en spesiell gissel og hemmeligheten om det virkelige formålet med Seraph of the End-prosjektet.
