I "The Legend of Zelda: Twilight Princess, Vol. 9" må Link konfrontere ondskap i alle former på sin livsfarlige ferd for å hjelpe prinsesse Zelda! Historien begynner i en tid hvor trollmenn forsøkte å erobre Hyrules hellige rike. For å stoppe dem, ble lysåndene nødt til å forsegle trollmennenes makt i Skyggekristallet og forvise dem til Twilight-riket, som ligger bak Mirror of Twilight. Nå er en ny ondskap på jakt etter Midna, prinsessen av Twilight-riket, samt fragmentene av Skyggekristallet, for å få makten til å herske over både Twilight-riket og Lysverdenen. Midna deler med Link minnene fra tiden før hun kom inn i Lysverdenen, og hvordan den onde trollmannen Zant forvandlet henne til sin nåværende skikkelse. Fyllt med bitre følelser og sinne, har Midna tidligere manipulert andre for å oppnå sin hevn. Nå trenger Link hennes hjelp mer enn noen gang, og hans tilgivelse kan gi henne den styrken hun trenger for å fortsette kampen. Foran dem ligger større farer enn de noen gang har møtt i Twilight-riket, inkludert Midnas nemesis, den utspekulerte trollmannen Zant.
