I den fascinerende verden av Tokyo Ghoul er det noen ganger slik at den eneste måten å bekjempe monstre på, er å bli en av dem. Kommisjonen for mottiltak mot ghouler står som det eneste organet som bekjemper trusselen fra ghouler, og de er villige til å bruke alle tilgjengelige midler for å beskytte menneskeheten mot denne ultimate rovdyret. Deres nyeste våpen i denne skjulte krigen er en eksperimentell prosedyre som implanterer menneskelige etterforskere med en ghouls Kagune, noe som gir dem ghouls krefter og evner. Men både prosedyren og det nyoppstartede Qs laget er utestet. Vil de bli helter ... eller monstre? Haise Sasaki har ansvar for å omdanne de uregjerlige medlemmene av Qs-laget til en eliteenhet mot ghouler. Men med alt å bevise, vil hans team klare å takle utfordringene når de begynner å etterforske den mystiske organisasjonen Aogiri Tree? Og kan Haise være mentoren Qs-laget trenger, når hans glemte fortid kan komme tilbake for å hjemsøke ham når som helst?