I en episk fortelling fylt med spenning og følelser, tar 'Sky in the Deep' oss med til en verden der krig og overlevelse står i sentrum. Den sytten år gamle Eelyn, oppdratt til å bli en kriger, kjemper side om side med sine klanmedlemmer fra Aska i en urfordring mot Riki-klanen. Hennes tilværelse er hard, men enkel: kjemp for å overleve. Alt forandrer seg dramatisk den dagen hun ser noe umulig på slagmarken - hennes bror, som hun trodde var død for fem år siden, kjemper nå sammen med fienden. Konfrontert med sin brors svik, må Eelyn overvinne vinteren i fjellene hos Riki, i en landsby der hver nabo er en potensiell fiende, og hvert arr hun har på kroppen kan være et hun har påført selv. Når Riki-landet blir angrepet av en grusom klan man trodde var en myte, blir Eelyn mer desperat enn noen gang etter å komme tilbake til sin kjære familie. Hun får ikke valget om å stole på Fiske, venn av broren, som ser på henne som en trussel. Sammen står de overfor en umulig oppgave: å forene klanene for å kjempe mot en felles fiende.