I Frankrike i 1942, mens krigen raser på frontlinjene i Europa, er en modig gruppe kvinner i den murede sørlige byen Carcassonne, som ligger dypt i Pyreneen, involvert i en like dødelig kamp. Som sine forfedre som kjempet mot nordiske invasjonsstyrker for syv hundre år siden, kjemper disse medlemmene av den franske motstandsbevegelsen – kalt Citadel – for å befri hjemlandet sitt fra nazistene. Ledet av den dristige attenåringen Sandrine Vidal og hennes eldre søster Marianne, arbeider kvinnene i Citadel raskt for å sabotere de tyske okkupantene, beskytte sine naboer og smugle flyktninger over fjellene til nøytralt territorium. Men dette utgjør bare en del av deres oppdrag. Deres kamp vil avdekke en eldre, mørkere strid som utspiller seg i skyggene, en strid ment for å beskytte en eldgamle hemmelighet som i gale hender kan endre historiens gang. Når kvinnene i Citadel tør å gjøre det umulige for å redde sitt fedreland, blir de fantastiske hemmelighetene begravd i tid endelig avslørt.
