Mary Lennox er en bortskjemt og selvopptatt liten jente som alltid har fått det som hun vil. Etter at hun mister foreldrene sine, blir hun sendt for å bo hos sin onkel i Yorkshire, et sted hun hater. Men livet hennes tar en uventet vending når hun oppdager inngangen til en hemmelig hage. Denne magiske hagen blir et fristed for Mary, og sammen med en lokal gutt og sin kusine, begynner de tre barna å transformere seg selv og de som er rundt dem. Deres opplevelser i den hemmelige hagen leder til nye vennskap, personlig vekst, og en gjenoppdagelse av naturens forunderlige kraft.