I "The Dark Side of the Enlightenment" utforsker John V. Fleming hvordan impulser fra den europeiske opplysningstiden, som vanligvis forbindes med betydelige fremskritt i frigjøringen av menneskelig tanke fra overtro og tradisjonell religion, ble utfordret av seiglivede religiøse ideer eller kanalisert inn i de mer 'mørke' syslene av esoterisme og det okkulte. Fleming tar for seg engasjerende emner som den vedvarende overlevelsen av det mirakuløse, opplysningstidens rolle for rosenkreuzerbevegelsen og frimureriet, samt den utbredte jakten på magi og alkymi. Selv om vi vanligvis ikke forbinder det som en gang ble kalt alkymi med det vi i dag kaller kjemi, demonstrerer Fleming at forskjellen kun er en språklig modernisering. Alkymi var en gang den daværende kjemi, av arabisk opprinnelse, og dens utøvere var blant de fremste vitenskapsmenn og legene i sin tid. Ingen faktor er viktigere for å forstå de merkelige og fascinerende skikkelsene i denne boken enn prestisjen som alkymi hadde blant de lærde mennene i perioden.